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實體表達式

本文介紹如何使用實體表達式來代表特定樣本的屬性數據。

基因分析平臺通過基因實體表格來管理基因數據文件,舉例來說,某個生物樣本(S001),其擁有多個屬性值。FASTQ1單元格里的值,即為該樣本存在對象存儲OSS的原始序列文件。同時表格之間通過引用關系,來定義生物樣本所從屬的病人(NO011121)。

實體表格

為此,我們設計了平臺的實體表達式,可以在模板中,支持應用訪問任意樣本的特定屬性值。

$this.attribute.attribute
  • $this 指代根實體類型,如sample

  • "."運算符用于訪問左邊實體的屬性,如果解析結果仍為實體類型,則可以繼續通過“.”進行訪問

范例1:

對于表達式 $this.FASTQ1, 根實體是sample的話,則代表的應用輸入是某一個樣本的FASTQ1文件。

范例2:

對于表達式 $this.Samples.FASTQ1, 根實體是Patient的話,則代表應用的輸入是該病人所有樣本的FASTQ1文件列表。