基因數據除測序文件（如FASTQ，BAM等）外，還需要包括臨床、樣本、實驗等相關元數據信息，這些組合在一起，才能形成生物醫學多組學的大數據。

除使用阿里云對象存儲OSS為基因數據文件提供安全、可靠、無限的存儲空間外，基因分析平臺設計了符合生物樣本數據（如患者、樣本、組織等）管理需要的實體概念。實體（Entity）通過csv表格的形式，來定義包含的數據屬性，并支持不同實體之間相互引用，以組織復雜的多組學數據。

平臺中的實體表格完全由用戶自定義，支持添加、編輯以及下載實體表格，并且可以選擇實體表格數據啟動批量分析任務。

步驟一：用戶可以通過上傳csv文件，在工作空間中添加新的實體表格。平臺提供“新建空白模板”功能，編輯名稱和屬性列后，可以下載csv模板。

• 實體名稱：工作空間下唯一，由數字、字母、下劃線、連接符組成，長度不超過64個字符，且不能以數字或者連接符開頭。

• 首列名：ID列，無需輸入，必須符合“<實體名稱>_id”規則。

• 新增列：支持新增任意多列來描述實體屬性。

  • 列名稱：合法變量名稱，實體內列名稱不能重復。

  • 列類型：默認為字符值，即單元格內容為文本。同時支持下拉選擇其他“實體引用”，即單元格內容為引用實體的首列ID

步驟二：點擊確定后，瀏覽器會自動下載該實體的csv模板到本地，用戶可以通過Excel軟件或者其他文本編輯器，批量編輯內容后保存。

步驟三：然后通過“上傳表格文件”, 將包含數據的csv文件上傳平臺。

點擊確定，上傳成功后，即可在工作空間內查看實體數據表格。

對基因分析平臺中已經添加成功的實體，用戶有兩種方式可以進行數據的更新。

• 編輯實體表格對應的csv文件，保存后再次上傳，即可更新數據。

  • 可新增任意列和任意行數據，上傳成功后，將增量更新表格內容。

  • 如果列名和首列ID一致，則csv中的內容，將會覆蓋更新表格內容。

• 直接在網頁中進行編輯

  • 鼠標移動到單元格的內容上，會出現編輯圖標，點擊后即可編輯表格內容。

用戶可以按行選中實體表格內容，對“已選中的數據”進行刪除操作。實體表格中所有行被刪除后，實體表格自動被刪除。

如用戶已使用該實體創建應用模板，則可以按行選中實體表格內容，對“已選中的數據”進行“啟動分析”。平臺展示與當前實體類型相匹配的分析模板，幫助用戶快速批量提交運行任務。詳細說明請參考最佳實踐。