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基因數(shù)據(jù)文件

更新時(shí)間:

本文介紹基因分析平臺(tái)中基因數(shù)據(jù)文件的使用方法,包括上傳、下載、刪除等操作。

基因分析平臺(tái)并不直接提供基因數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)功能,而是依賴(lài)于阿里云對(duì)象存儲(chǔ)OSS來(lái)幫助用戶(hù)管理自己的基因數(shù)據(jù)文件。在開(kāi)通基因分析平臺(tái)時(shí),由用戶(hù)授權(quán)給基因分析平臺(tái)訪(fǎng)問(wèn)用戶(hù)OSS的角色權(quán)限,平臺(tái)的運(yùn)行任務(wù)從用戶(hù)OSS中獲得計(jì)算輸入,最終計(jì)算結(jié)果也寫(xiě)回用戶(hù)的OSS中。

基因分析平臺(tái)工作空間內(nèi)數(shù)據(jù)管理頁(yè)面,內(nèi)嵌了OSS功能,幫助用戶(hù)上傳/下載/刪除基因數(shù)據(jù)文件,這些與用戶(hù)直接在OSS控制臺(tái)中操作完全等同。

工作空間文件
說(shuō)明

工作空間中數(shù)據(jù)管理的文件頁(yè)面,默認(rèn)展示的是工作空間綁定的OSS存儲(chǔ)桶中的數(shù)據(jù)文件。用戶(hù)也可以下拉切換訪(fǎng)問(wèn)該區(qū)域內(nèi)任意有權(quán)限的OSS存儲(chǔ)桶。

管理工具

用戶(hù)可以使用所有對(duì)象存儲(chǔ)OSS常用工具匯總,來(lái)管理基因數(shù)據(jù)文件,支持網(wǎng)頁(yè)、圖形客戶(hù)端、命令行工具等多種途徑。

上傳途徑

在上傳文件彈窗頁(yè)面中,平臺(tái)提供了與該工作空間關(guān)聯(lián)的OSS存儲(chǔ)桶名稱(chēng)和所在區(qū)域。根據(jù)這些信息,用戶(hù)就可以進(jìn)行相應(yīng)的上傳、下載、刪除操作。

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本地基因數(shù)據(jù)上傳/下載

用戶(hù)本地?cái)?shù)據(jù)可以使用上述工具上傳到基因分析平臺(tái)工作空間中,計(jì)算分析結(jié)果按照同樣的方式下載到本地。不同工具的選擇建議如下:

  • 網(wǎng)頁(yè)上傳文件單個(gè)大小不能超過(guò)5G,且需保持打開(kāi)網(wǎng)頁(yè),中斷后無(wú)法恢復(fù),適用于直接上傳小文件。

  • OSSBrowser客戶(hù)端提供圖形操作界面,無(wú)大小限制,支持并行上傳和中斷恢復(fù),適用于用戶(hù)個(gè)人電腦上傳基因數(shù)據(jù)文件,方便簡(jiǎn)單。

  • OSSUtils命令行工具,無(wú)大小限制,支持并行上傳和中斷恢復(fù),適用于用戶(hù)本地服務(wù)器或者HPC集群上傳基因數(shù)據(jù)文件,并且可以通過(guò)編寫(xiě)腳本的方式,實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化上傳。

  • 離線(xiàn)遷移(閃電立方),單次TB到PB級(jí)別的本地?cái)?shù)據(jù)遷移上云,適用于本地機(jī)房帶寬較小或無(wú)公網(wǎng),歷史大批量數(shù)據(jù)的搬遷。

說(shuō)明

基因數(shù)據(jù)上傳到OSS中無(wú)需付費(fèi),但存儲(chǔ)和下載需要收取相應(yīng)的費(fèi)用,具體請(qǐng)查看對(duì)象存儲(chǔ)OSS的計(jì)費(fèi)概述。

其他來(lái)源數(shù)據(jù)處理方式

阿里云其他用戶(hù)賬號(hào)數(shù)據(jù)

如果用戶(hù)的基因數(shù)據(jù)來(lái)源與其他阿里云用戶(hù),如測(cè)序服務(wù)商??捎蓪?duì)方通過(guò)阿里云訪(fǎng)問(wèn)控制(RAM)授權(quán)你訪(fǎng)問(wèn)存儲(chǔ)數(shù)據(jù)的bucket(見(jiàn)常見(jiàn)問(wèn)題中“基因分析平臺(tái)能否跨賬號(hào)訪(fǎng)問(wèn)OSS資源”),然后基因分析平臺(tái)即可使用。

其他公有云廠(chǎng)商數(shù)據(jù)

如果用戶(hù)的基因數(shù)據(jù)存儲(chǔ)在其他公有云廠(chǎng)商中,可以通過(guò)阿里云的在線(xiàn)遷移服務(wù),導(dǎo)入到基因分析平臺(tái)的工作空間中,即可使用。