阿里云基因分析平臺是由阿里云完全托管,專門服務于基因測序行業的公有云產品。與傳統的HPC集相比,無需任何前期投入,完全享有云計算敏捷靈活、按需付費和超大規模的優勢。并且產品圍繞基因行業的數據和應用特點,開發了眾多專業能力,降低最終用戶的學習成本,無需了解IT或者生信知識,專注于自己業務領域知識即可。
與HPC集群對比
對比項 | 基因分析平臺 | HPC集群 |
---|---|---|
成本投入 | 無需任何前期投入,支持從0到千萬的樣本分析需求,完全按需計費,精確到單樣本。 | 一次性購買基礎設施,需要提前規劃容量,成本壓力大,不夠靈活。 |
運維管理 | 完全無服務計算,無需創建和管理任何集群,按業務需求自動擴展規模,0運維負擔。 | 需要創建和管理維護集群,維護集群健康狀態,進行擴縮容管理,需要專業IT人員,任務繁重。 |
分析能力 | 提供流程執行引擎,支持用戶直接管理和運行生信流程,并且提供錯誤重試、中斷恢復等高級功能。 | 只提供基礎的計算作業調度功能,用戶需要自己實現流程管理功能。難以滿足簡單可靠執行復雜流程的需求。 |
開發成本 | 支持GA4GH的行業標準,用戶應用無需改造和遷移。開源社區支持,擁有眾多開發者工具和分析應用在內的社區資源。 | 沒有流程標準,無法遷移,難以版本化管理。缺少相應的開發、校驗和可視化的配套支持。 |
應用生態 | 與Sentieon等工具開發者合作,為平臺用戶提供開箱即用的工具鏡像、加速軟件算法和公共數據集。 | 缺少公共可用資源,需要自己下載、安裝和購買眾多數據和軟件。普通用戶通常遇到眾多使用困難。 |
數據安全 | 完全基于阿里云的基礎設施和成熟的產品技術開發,數據傳輸存儲加密,提供細粒度的權限管理,能滿足生物醫學數據的隱私安全保護需求。 | 缺少安全相關的系統設計,無法保證基因數據的存儲、計算和共享等方面的安全要求。 |
基因分析平臺的產品優勢
Serverless計算
強大的無服務計算引擎,用戶無需創建和維護集群,完全按需彈性擴展計算資源,能夠支持成百上千的樣本高通量的進行同時分析。
標準流程語言
支持GA4GH社區的流程語言標準(WDL/CWL),確保生信應用可遷移,可重復,能夠版本化管理。同時滿足一次開發,多處運行,CI/CD持續集成的需求。
存儲計算優化
支持按照vCPU和MEM細粒度申請資源,動態實例,以及FPGA/GPU等異構加速硬件。計算存儲支持OSS訪問,提供緩存加速功能。大幅提高效率和降低成本。提供詳細計費賬單,精確到單樣本的費用,經濟可靠
效率工具集成
按照WDL/CWL標準,通過應用倉庫集成包括Sentieon、FPGA/GPU在內分析加速工具。平臺簡化了第三方軟件的使用,用戶可以從頭開發,或者任意組合這些效率工具到已有的工作流程中。
開發者友好
所有平臺功能均提供OpenAPI和SDK,集成監控,日志,費用審計等功能。方便對接上下游業務系統。配合社區開發工具套件,可配置實現自動化分析或開發下游系統。