產(chǎn)品動態(tài)
本文介紹基因分析平臺的版本變更信息，包括發(fā)布時間、版本變更內(nèi)容、核心功能特性等信息。
2024年10月
模塊 | 功能項 | 子功能點 | 具體功能項說明 |
應(yīng)用倉庫 | 全基因組選擇 | damo/genomic-selection-dataset | 【新增】全基因組選擇算法數(shù)據(jù)集構(gòu)建 |
damo/genomic-selection-train | 【新增】全基因組選擇算法模型訓(xùn)練 | ||
damo/genomic-selection-pred-self | 【新增】全基因組選擇算法自交系表型預(yù)測 | ||
damo/genomic-selection-pred-f1 | 【新增】全基因組選擇算法雜交F1代表型預(yù)測 |
2024年9月
模塊 | 功能項 | 子功能點 | 具體功能項說明 |
應(yīng)用配置 | 創(chuàng)建應(yīng)用（WDL） | runtime | 【新增】支持runtime中同時指定多個規(guī)格的機器，如type=gc6.small,gc5.medium,gc4.medium |
【新增】支持runtime中直接聲明磁盤大?。ù藭r默認使用nas_cap數(shù)據(jù)盤類型） | |||
【新增】runtime中支持cloud_essd、cloud_essd_pl1、nas_per、nas_cap四種數(shù)據(jù)盤類型 | |||
【新增】runtime中支持通過env指定掛載oss bucket(兼容掛載同賬號和跨賬號的oss bucket) | |||
【新增】runtime中支持設(shè)置sentieon license環(huán)境變量的方式使用sentieon | |||
運行選項設(shè)置 | 【新增】支持選擇數(shù)據(jù)加載模式為掛載或下載（前端默認掛載） | ||
應(yīng)用倉庫 | 變異分析 | sentieon | 【更新】sentieon需要通過設(shè)置sentieon license環(huán)境變量的方式繼續(xù)使用 |
序列比對 | damo/vardict | 【新增】CPU并行加速的vardict | |
damo/bwa-mem2 | 【新增】基于云優(yōu)化的bwa-mem2 | ||
damo/bwa-mem2-index | 【新增】bwa-mem2索引構(gòu)建 | ||
damo/blastn | 【新增】基于云優(yōu)化的blastn | ||
damo/blastn-makedb | 【新增】blastn數(shù)據(jù)庫構(gòu)建 |
2024年8月
模塊 | 功能項 | 子功能點 | 具體功能項說明 |
應(yīng)用倉庫 | 序列比對 | damo/align-markdup-bqsr | 【新增】GPU版本序列比對排序去重bqsr |
變異識別 | damo/haplotype-calling | 【新增】GPU版本HaplotypecCaller | |
序列壓縮 | damo/fqcompress | 【新增】高壓縮比的fastq壓縮 | |
damo/fqdecompress | 【新增】高壓縮比的fastq解壓 | ||
變異識別索引 | damo/dna-index | 【新增】GPU變異分析流程索引構(gòu)建 |
2024年6月
模塊 | 功能項 | 子功能點 | 具體功能項說明 |
應(yīng)用倉庫 | 群體變異識別 | damo/dna-variant-calling | 【新增】GPU變異分析流程 |
damo/joint-calling | 【新增】CPU+GPU群體變異分析流程 |
2021年5月
發(fā)布時間 | 版本變更內(nèi)容 | 核心功能特性 |
2021-05-28 | 基因分析平臺公測發(fā)布 |
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