E-HPC提供了業界主流的科學計算應用、編譯器運行時庫、MPI通信庫等軟件,本文介紹E-HPC提供的常用軟件,以及軟件相關的應用場景等。
E-HPC支持的軟件
本文列出支持通過控制臺自動部署的軟件,您也可以通過自定義鏡像的方式自行部署其他需要的軟件。
類別 | 名稱 | 版本 | 簡介 |
生命科學 | gromacs | 2024.1 | 用于分子動力學模擬。 |
vina | 1.2.5 | 用于分子對接的自動化程序,主要用于預測蛋白質和小分子之間的最佳結合模式。 | |
通用 | erdma-installer | 最新 | 用于安裝和配置eRDMA。 |
gcc | 12.3.0 | gnu基礎編譯器。 | |
armpl | 24.04 | ARM數學庫。 | |
mpich | 4.0.3 | MPI開源實現發行版本MPICH。 | |
libfabric |
| 用于高性能計算的軟件庫,提供了低級別的網絡通信功能。 | |
libfabric-cae | 1.17.0 | 專為工業仿真(CAE)設計的軟件庫,提供了低級別的網絡通信功能,并集成了針對工業仿真計算需求優化的預設參數配置。 | |
aocl | 4.0.1 | AMD數學庫。 | |
szip | 2.0.0 | 用于無損壓縮數據的軟件庫。 | |
zlib | 1.2.13 | 用于壓縮數據的軟件庫。 | |
netcdf | 4.8.0 | 用于科學數據存儲和分析的文件格式和軟件庫。 | |
hdf5 | 1.10.5 | 用于存儲和處理大規模科學數據的文件格式和軟件庫。 | |
aocc | 4.0.0 | AMD的基礎編譯器發行版。 | |
mpich-aocc | 4.0.3 | 基于AMD架構的MPI開源實現發行版本MPICH。 | |
docker | 23.0.1 | 一個開放平臺,用于開發、發布和運行應用程序。 | |
大數據 | fastmr | 1.2.1 | 用于阿里云大數據集群自動化部署與測試,快速完成大數據業務選型PoC。 |
氣象 | wrf-aocc | 4.4.2 | 基于AOCC編譯的高性能氣象模擬軟件。 |
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您可以根據業務需求安裝相關軟件。具體操作,請參見安裝和卸載集群軟件。