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首頁 彈性高性能計(jì)算 E-HPC NEXT 快速入門 通過控制臺(tái)快速創(chuàng)建和管理集群

通過控制臺(tái)快速創(chuàng)建和管理集群

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本入門教程介紹如何通過E-HPC控制臺(tái)快速創(chuàng)建一個(gè)公共云標(biāo)準(zhǔn)版的集群并進(jìn)行管理，幫助您快速上手使用彈性高性能計(jì)算產(chǎn)品。

前提條件

創(chuàng)建集群

  1. 單擊前往創(chuàng)建集群頁面。

  2. 在創(chuàng)建集群頁面，完成以下各步驟的參數(shù)配置。

    1. 集群配置

      • 基礎(chǔ)設(shè)置

        配置項(xiàng)

        示例

        說明

        地域

        華東 1（杭州）

        選擇集群所在地域。

        網(wǎng)絡(luò)及可用區(qū)

        • 專有網(wǎng)絡(luò)：vpc-bp1opxu1zkhn00g****

        • 交換機(jī)：vsw-bp1ljgg5tjrs62n64****

        選擇集群所在的專有網(wǎng)絡(luò)和交換機(jī)。

        說明

        集群內(nèi)的節(jié)點(diǎn)會(huì)占用所選交換機(jī)的IP地址，請(qǐng)確保交換機(jī)下的可用IP地址數(shù)大于所需的節(jié)點(diǎn)數(shù)量。

        安全組

        選擇自動(dòng)創(chuàng)建普通安全組。

        安全組用于控制集群及其節(jié)點(diǎn)的出入流量。系統(tǒng)自動(dòng)創(chuàng)建的安全組會(huì)自動(dòng)添加規(guī)則，保證集群內(nèi)的各節(jié)點(diǎn)通信。

        請(qǐng)根據(jù)需要選擇自動(dòng)創(chuàng)建的安全組類型。關(guān)于普通安全組和企業(yè)安全組的差異，請(qǐng)參見普通安全組與企業(yè)級(jí)安全組。

      • 集群類型

        本文演示如何創(chuàng)建公共云標(biāo)準(zhǔn)版集群，該類型集群由一個(gè)管理節(jié)點(diǎn)和多個(gè)計(jì)算節(jié)點(diǎn)組成。您需要選擇集群部署的調(diào)度器類型，并配置管理節(jié)點(diǎn)。

        配置項(xiàng)

        示例

        說明

        系列

        選擇標(biāo)準(zhǔn)版。

        集群的系列。

        部署模式

        選擇公共云集群。

        集群的部署模式。

        集群類型

        選擇SLURM。

        選擇集群的調(diào)度器類型。支持HPC場(chǎng)景常用調(diào)度器，包括Slurm、OpenPBS和Grid Engine。

        管理節(jié)點(diǎn)

        • 規(guī)格族：通用型g6

        • 實(shí)例規(guī)格：ecs.g6.large

        • 鏡像：CentOS 7.6 64 位

        • 存儲(chǔ)：系統(tǒng)盤40G、ESSD云盤PL0

        • 超線程：?jiǎn)⒂?/p>

        管理節(jié)點(diǎn)是一臺(tái)部署了調(diào)度器和域賬號(hào)服務(wù)的ECS實(shí)例。請(qǐng)根據(jù)業(yè)務(wù)場(chǎng)景和集群規(guī)模，為管理節(jié)點(diǎn)選擇合適的配置。

        • 付費(fèi)模式

          選擇如何為管理節(jié)點(diǎn)付費(fèi)。具體計(jì)費(fèi)說明，請(qǐng)參見實(shí)例規(guī)格計(jì)費(fèi)。

          • 按量付費(fèi)：后付費(fèi)，按實(shí)際使用時(shí)長(zhǎng)計(jì)費(fèi)，不支持搶占式實(shí)例。

          • 包年包月。預(yù)付費(fèi)，按周、月、年計(jì)費(fèi)。

        • 實(shí)例規(guī)格

          選擇合適的管理節(jié)點(diǎn)規(guī)格。對(duì)于不同規(guī)模的集群，推薦的管理節(jié)點(diǎn)規(guī)格如下：

          • 如果計(jì)算節(jié)點(diǎn)數(shù)≤100個(gè)，管理節(jié)點(diǎn)規(guī)格建議vCPU≥16核，內(nèi)存≥64 GiB。

          • 如果計(jì)算節(jié)點(diǎn)數(shù)≤500個(gè)，管理節(jié)點(diǎn)規(guī)格建議vCPU≥32核，內(nèi)存≥128 GiB。

          • 如果計(jì)算節(jié)點(diǎn)數(shù)＞500個(gè)，管理節(jié)點(diǎn)規(guī)格建議vCPU≥64核，內(nèi)存≥256 GiB。

        • 鏡像

          選擇用于部署管理節(jié)點(diǎn)環(huán)境的鏡像。不同鏡像支持的調(diào)度器不同，以界面顯示為準(zhǔn)。

        • 存儲(chǔ)

          選擇管理節(jié)點(diǎn)的系統(tǒng)盤規(guī)格，以及是否掛載數(shù)據(jù)盤。關(guān)于云盤的類型和性能等信息，請(qǐng)參見云盤概述。

        • 超線程

          默認(rèn)開啟CPU超線程，如果您的業(yè)務(wù)場(chǎng)景需要獲得更好的性能表現(xiàn)，可以關(guān)閉CPU超線程。

    2. 計(jì)算節(jié)點(diǎn)與隊(duì)列

      • 基本設(shè)置

        配置項(xiàng)

        示例

        說明

        隊(duì)列自動(dòng)伸縮

        不開啟

        選擇是否開啟自動(dòng)伸縮。開啟后，可進(jìn)一步按需選擇是否開啟自動(dòng)擴(kuò)容和自動(dòng)縮容。

        開啟自動(dòng)伸縮后，系統(tǒng)會(huì)根據(jù)配置信息和實(shí)時(shí)負(fù)載，自動(dòng)增加或者減少計(jì)算節(jié)點(diǎn)。

        隊(duì)列節(jié)點(diǎn)數(shù)

        5

        設(shè)置隊(duì)列包含的節(jié)點(diǎn)數(shù)量。

        • 如果沒有開啟隊(duì)列自動(dòng)伸縮，請(qǐng)配置隊(duì)列初始的計(jì)算節(jié)點(diǎn)數(shù)量。

        • 如果開啟了隊(duì)列自動(dòng)伸縮，請(qǐng)配置隊(duì)列允許的最小節(jié)點(diǎn)數(shù)和最大節(jié)點(diǎn)數(shù)。

          重要

          如果將最小節(jié)點(diǎn)數(shù)修改為非0值，集群縮容時(shí)該隊(duì)列會(huì)保留最小節(jié)點(diǎn)數(shù)量的節(jié)點(diǎn)，即使是空閑節(jié)點(diǎn)也不會(huì)被釋放。請(qǐng)您謹(jǐn)慎設(shè)置最小節(jié)點(diǎn)數(shù)，以免導(dǎo)致自動(dòng)縮容后隊(duì)列中存在空閑節(jié)點(diǎn)，造成資源浪費(fèi)和不必要的經(jīng)濟(jì)損失。

      • 選擇隊(duì)列節(jié)點(diǎn)配置

        配置項(xiàng)

        示例

        說明

        節(jié)點(diǎn)間互聯(lián)

        選擇VPC網(wǎng)絡(luò)。

        選擇節(jié)點(diǎn)之間網(wǎng)絡(luò)連通方式。

        • VPC：節(jié)點(diǎn)之間通過VPC網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行通信。

        • eRDMA：如果節(jié)點(diǎn)使用支持ERI的規(guī)格，則節(jié)點(diǎn)之間可以通過eRDMA網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行通信。

          說明

          僅部分節(jié)點(diǎn)規(guī)格支持ERI，更多信息，請(qǐng)參見eRDMA概述和在企業(yè)級(jí)實(shí)例上配置eRDMA。

        虛擬交換機(jī)

        vsw-bp1ljgg5tjrs62n64****

        選擇節(jié)點(diǎn)所屬的交換機(jī)。系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)從可用的交換機(jī)網(wǎng)段中為節(jié)點(diǎn)分配IP地址。

        實(shí)例規(guī)格組

        • 規(guī)格族：通用型g6

        • 實(shí)例規(guī)格：ecs.g6.large

        • 鏡像：CentOS 7.6 64 位

        • 存儲(chǔ)：系統(tǒng)盤40G、ESSD云盤PL0

        • 超線程：?jiǎn)⒂?/p>

        單擊添加實(shí)例規(guī)格，選擇節(jié)點(diǎn)的規(guī)格。

        如果未開啟自動(dòng)伸縮，則僅支持添加一個(gè)實(shí)例規(guī)格；如果開啟了自動(dòng)伸縮，則支持添加多個(gè)實(shí)例規(guī)格。

    3. 共享文件存儲(chǔ)

      配置項(xiàng)

      示例

      說明

      類型

      選擇通用型NAS。

      選擇要掛載的文件系統(tǒng)類型。

      • 通用型NAS：掛載通用型NAS文件系統(tǒng)。

      • 極速型NAS：掛載極速型NAS文件系統(tǒng)。

      • 并行文件CPFS：使用NFS協(xié)議掛載CPFS文件系統(tǒng)。

      文件系統(tǒng)

      0e9104****（容量型 NFS）

      選擇要掛載的文件系統(tǒng)ID和掛載點(diǎn)，請(qǐng)確保該文件系統(tǒng)還有可用的掛載點(diǎn)余量。

      文件系統(tǒng)目錄

      0e9104****-tpd33.cn.hangzhou.nas.aliyuncs.com

      輸入要掛載的文件系統(tǒng)目錄。

      掛載選項(xiàng)

      選擇NFS v3掛載。

      選擇掛載協(xié)議。

    4. 軟件與服務(wù)組件

      無需設(shè)置，默認(rèn)已配置一個(gè)登錄節(jié)點(diǎn)。

    5. 確認(rèn)配置

      確認(rèn)配置信息，并配置集群名稱和登錄憑證。

      配置項(xiàng)

      示例

      說明

      集群名稱

      E-HPC-test

      輸入名稱。該名稱會(huì)在集群列表中顯示，便于您查找識(shí)別。

      登錄憑證

      選擇自定義密碼。

      選擇登錄集群的憑證。目前僅支持自定義密碼。

      設(shè)置密碼、確認(rèn)密碼

      Ehpc12****

      輸入登錄集群的密碼。集群中所有節(jié)點(diǎn)默認(rèn)使用該密碼作為root用戶的登錄密碼。

  3. 閱讀服務(wù)與協(xié)議，確認(rèn)費(fèi)用信息，然后單擊創(chuàng)建集群。

    在集群列表頁面，如果出現(xiàn)名為E-HPC-test且狀態(tài)為運(yùn)行中的集群，則表示該集群已成功創(chuàng)建。

創(chuàng)建用戶

在集群中提交作業(yè)前，您需要為集群新增用戶。

  1. 在用戶管理頁面，單擊新增用戶。

  2. 在彈出的對(duì)話框中，完成用戶信息配置，然后單擊確定。

    配置項(xiàng)

    示例

    說明

    用戶名

    test.user

    用戶名稱，自定義輸入。

    • 限制為6~30個(gè)字符。

    • 以英文開頭。

    • 英文字母數(shù)字或符號(hào)（.）組成。

    用戶權(quán)限

    sudo權(quán)限組

    • 普通權(quán)限組：適用于只有提交、調(diào)試作業(yè)需求的普通用戶。

    • sudo權(quán)限組：適用于需要管理集群的管理員。除提交、調(diào)試作業(yè)外，還可以執(zhí)行sudo命令進(jìn)行安裝軟件、重啟節(jié)點(diǎn)等操作。

      重要

      請(qǐng)謹(jǐn)慎分配sudo權(quán)限。具有sudo權(quán)限的用戶如果操作錯(cuò)誤（如誤刪除E-HPC軟件棧模塊），會(huì)導(dǎo)致集群異常。

    密碼、確認(rèn)密碼

    Ehpc12****

    根據(jù)頁面提示，設(shè)置用戶使用密碼登錄集群時(shí)，需要輸入的密碼。

擴(kuò)容集群

  1. 在集群列表頁面，單擊目標(biāo)集群名稱。

  2. 在左側(cè)導(dǎo)航欄，選擇節(jié)點(diǎn)與隊(duì)列 > 節(jié)點(diǎn)。

  3. 單擊添加節(jié)點(diǎn)，在添加節(jié)點(diǎn)頁面配置以下參數(shù)。

    • 基礎(chǔ)設(shè)置

      配置項(xiàng)

      示例

      說明

      目標(biāo)隊(duì)列

      comp

      選擇該集群內(nèi)已創(chuàng)建的隊(duì)列。

      節(jié)點(diǎn)數(shù)

      10

      設(shè)置需要擴(kuò)容的節(jié)點(diǎn)數(shù)量。

    • 節(jié)點(diǎn)配置

      配置項(xiàng)

      示例

      說明

      選擇節(jié)點(diǎn)類型

      新建節(jié)點(diǎn)

      僅支持選擇新建節(jié)點(diǎn)。

      節(jié)點(diǎn)間互聯(lián)

      VPC網(wǎng)絡(luò)

      選擇節(jié)點(diǎn)之間網(wǎng)絡(luò)連通方式。

      • VPC網(wǎng)絡(luò)：節(jié)點(diǎn)之間通過VPC網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行通信。

      • eRDMA網(wǎng)絡(luò)：如果節(jié)點(diǎn)使用支持ERI的規(guī)格，則節(jié)點(diǎn)之間可以通過eRDMA網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行通信。

        說明

        僅部分節(jié)點(diǎn)規(guī)格支持ERI，更多信息，請(qǐng)參見eRDMA概述和在企業(yè)級(jí)實(shí)例上配置eRDMA。

      虛擬交換機(jī)

      vsw-bp1ljgg5tjrs62n64****

      選擇節(jié)點(diǎn)所屬的交換機(jī)。系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)從可用的交換機(jī)網(wǎng)段中為節(jié)點(diǎn)分配IP地址。

      實(shí)例規(guī)格組

      • 規(guī)格族：通用型g6

      • 實(shí)例規(guī)格：ecs.g6.large

      • 鏡像：CentOS 7.6 64 位

      • 存儲(chǔ)：系統(tǒng)盤40G、ESSD云盤PL0

      • 超線程：?jiǎn)⒂?/p>

      單擊添加實(shí)例規(guī)格，選擇節(jié)點(diǎn)的規(guī)格。

      如果未開啟自動(dòng)伸縮，則僅支持添加一個(gè)實(shí)例規(guī)格；如果開啟了自動(dòng)伸縮，則支持添加多個(gè)實(shí)例規(guī)格。

  4. 選中我已知曉：添加節(jié)點(diǎn)默認(rèn)開啟“刪除保護(hù)”功能，不受隊(duì)列伸縮配置影響，然后單擊確認(rèn)添加。

    您可以在節(jié)點(diǎn)列表中查看已擴(kuò)容節(jié)點(diǎn)的狀態(tài)。當(dāng)該節(jié)點(diǎn)狀態(tài)為運(yùn)行中，說明擴(kuò)容集群已完成。

提交作業(yè)

  1. 在集群詳情頁面左側(cè)導(dǎo)航欄，單擊作業(yè)管理。

  2. 單擊創(chuàng)建作業(yè)。

  3. 在創(chuàng)建作業(yè)頁面，根據(jù)實(shí)際需要完成相關(guān)配置，然后單擊確認(rèn)創(chuàng)建。

    說明

    請(qǐng)注意以下配置，未提及的配置請(qǐng)保持默認(rèn)。更多配置詳情，請(qǐng)參見提交作業(yè)。

    配置項(xiàng)

    是否必選

    示例

    說明

    作業(yè)名稱

    是

    testjob

    該作業(yè)的名稱。

    調(diào)度器隊(duì)列

    是

    comp

    選擇集群中執(zhí)行作業(yè)任務(wù)的隊(duì)列。

    執(zhí)行命令

    是

    /home/test.user/testjob.slurm

    向調(diào)度器提交的作業(yè)執(zhí)行命令，可以是腳本文件，也可以是一段命令文本。分為以下兩種情況：

    • 腳本文件可執(zhí)行，填寫相對(duì)路徑，如/home/test.user/testjob.slurm。

    • 腳本文件沒有可執(zhí)行權(quán)限，則需要填寫執(zhí)行命令，如：/opt/mpi/bin/mpirun /home/test/job.slurm。

刪除節(jié)點(diǎn)

對(duì)于不再需要的計(jì)算節(jié)點(diǎn)，您可以執(zhí)行刪除操作將節(jié)點(diǎn)從集群中移除。

  1. 在節(jié)點(diǎn)列表中選中一個(gè)或多個(gè)節(jié)點(diǎn)。

  2. 在列表下方單擊刪除。

  3. 確認(rèn)提示信息，然后單擊確定。

釋放集群

當(dāng)您不再需要某個(gè)集群提供服務(wù)時(shí)，您可以釋放該集群。

  1. 在集群詳情頁面，單擊右上角的更多操作，然后單擊釋放集群。

  2. 在彈出對(duì)話框中，單擊確認(rèn)。

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您可以通過集群模板快速創(chuàng)建一個(gè)預(yù)裝GROMACS軟件的集群，并通過E-HPC Portal快速提交作業(yè)。具體操作，請(qǐng)參見快速開啟GROMACS分析任務(wù)。