實踐教程

主要內容

使用LAMMPS軟件進行工業仿真

LAMMPS是一款經典分子動力學軟件，其包含的勢函數可用于固體材料（金屬、半導體）、軟物質（生物大分子，聚合物）、粗?；蚪橛^尺度模型體系。本教程介紹如何使用E-HPC集群運行LAMMPS開源仿真軟件，以3d Lennard-Jones melt模型進行工業仿真，并通過可視化的方式查看仿真結果。

使用Intel oneAPI編譯運行LAMMPS

E-HPC集群集成了Intel oneAPI工具包，該工具包結合HPC軟件使用，可以加快構建跨架構應用程序。本教程以LAMMPS軟件為例，介紹如何在E-HPC集群下使用Intel oneAPI編譯并運行LAMMPS。

使用GROMACS進行分子動力學模擬

GROMACS是一款通用軟件，用于對具有數百萬顆粒子的系統進行基于牛頓運動方程的分子動力學模擬，主要用于生物化學分子，如蛋白質、脂質等具有多種復雜鍵合相互作用的核酸分析。本教程以GROMACS軟件為例介紹如何在E-HPC上進行分子動力學模擬。

使用WRF軟件進行氣象模擬計算

WRF采用新一代中尺度天氣預報模式，是氣象行業廣泛應用的開源氣象模擬軟件。它為研究大氣過程提供了大量選項，并可以在多種計算平臺運行。本教程介紹如何使用E-HPC集群運行WRF軟件進行氣象模擬計算。

使用OpenFOAM軟件進行流體力學仿真計算

OpenFOAM是對連續介質力學問題進行數值計算的軟件?？蛇M行數據預處理、后處理和自定義求解器，常用于計算流體力學領域。本教程介紹如何使用E-HPC集群運行OpenFOAM進行流體力學仿真計算。

使用AutoDock Vina軟件進行藥物篩選

分子對接（Molecular docking）是虛擬藥物篩選中的關鍵環節。AutoDock Vina作為一款開源的分子對接軟件，具有速度快、算法準確等優點，特別適用于搭建基于分子對接的虛擬篩選。本教程介紹如何使用E-HPC集群運行AutoDock Vina進行藥物篩選。

使用Schrodinger軟件計算分子結構

Schrodinger基于物理學的計算平臺，集成了用于預測建模、數據分析的差異化解決方案，以實現對化學空間的快速探索，主要應用于藥物發現，以及航空航天、能源、半導體和電子顯示器等不同領域的材料科學。本教程介紹如何使用E-HPC集群運行Schrodinger軟件來計算分子結構。

實踐教程

主要內容

使用HPL測試E-HPC浮點性能

HPL（The High-Performance Linpack Benchmark）是測試高性能計算集群系統浮點性能的基準。HPL通過對高性能計算集群采用高斯消元法求解一元N次稠密線性代數方程組的測試，評價高性能計算集群的浮點計算能力。本教程介紹使用HPL測試E-HPC集群的浮點性能。

使用IMB軟件和MPI通信庫測試E-HPC通信性能

IMB（Intel MPI Benchmarks）用于評估HPC集群在不同消息粒度下節點間點對點、全局通信的效率。MPI（Message Passing Interface）是支持多編程語言的并行計算通信庫，具有高性能、大規模性、可移植性、可擴展性等特點。本教程以IMB軟件和MPI通信庫為例介紹如何測試E-HPC集群的通信性能。

測試SCC集群性能

超級計算集群SCC具有無虛擬化損耗、高帶寬低延遲網絡的優點，可以保證高性能計算和人工智能、機器學習等應用的高度并行需求本教程介紹如何創建SCC集群，并測試SCC集群的相關性能。

關閉CPU超線程以提升集群性能

E-HPC集群的每個計算節點都是一臺ECS實例，默認情況下，ECS實例均已開啟CPU超線程。在部分HPC場景下，可以關閉CPU超線程以獲得更好的性能表現。

通過MemVerge Memory Machine擴展內存

MemVerge Memory Machine是一款大內存算例加速軟件，支持可橫向擴展的內存節點集群，以提供HPC應用程序所需的大規模內存容量，以及內存系統的企業級數據服務和數據高可用性。本教程介紹如何在E-HPC集群中部署和使用Memory Machine。

實踐教程

主要內容

通過釘釘機器人發送事件通知

E-HPC配合事件總線EventBridge，可以將E-HPC集群操作、節點操作事件投遞到云服務專用事件總線，實現操作事件可接收、可查詢、可消費。您可以對E-HPC集群和節點事件配置規則，通過釘釘機器人發送事件通知到釘釘群，從而及時獲取E-HPC集群和節點的事件信息。

通過短信服務發送事件通知

E-HPC配合事件總線EventBridge，可以將E-HPC集群操作、節點操作事件投遞到云服務專用事件總線，實現操作事件可接收、可查詢、可消費。您可以對E-HPC集群和節點事件配置規則，通過短信服務發送事件通知短信到指定手機號碼，從而及時獲取E-HPC集群和節點的事件信息。

基于事件實現擴容水位超量告警

E-HPC配合事件總線EventBridge，可以將E-HPC集群的操作投遞到云服務專用事件總線。在此基礎上結合函數計算，可以更加靈活地將E-HPC事件進行二次定制投遞，例如可以使用E-HPC節點擴容事件制定擴容水位告警策略，并通過自定義事件總線將告警通過釘釘進行通知。

實踐教程

主要內容

混合云主控模式最佳實踐

以E-HPC云上集群將線下已有計算節點納入管理的場景為例，介紹混合云主控模式集群（SGE調度器，管理節點在云上集群）的部署方案。

混合云代理模式最佳實踐

以創建E-HPC代理模式的混合云集群，由線下已有集群的管理節點代為管理的場景為例，介紹混合云代理模式集群（SGE調度器，管理節點在已有集群）的部署方案。

使用插件部署混合云集群

本教程介紹如何使用E-HPC插件部署混合云集群，該集群由本地調度器、本地域控和云上計算節點等組成。

混合云渲染最佳實踐

以Deadline軟件為例，介紹在混合云環境下如何通過E-HPC及其文件緩存機制，借助云上彈性資源，構建云上云下一體化的高性能、高可靠性和可擴展的渲染服務。

實踐教程

主要內容

通過后處理腳本自定義部署擴容的計算節點

設置后處理腳本后，E-HPC集群上后續擴容的節點均會自動執行指定的后處理腳本，可以滿足計算節點預部署的需求。通過后處理腳本，您可以對計算節點做定制化操作，例如擴容的計算節點自動掛載ossfs、自動部署軟件環境等。

E-HPC集群與Windows AD域用戶賬號互通

將線下AD域用戶體系與云上E-HPC的集群LDAP用戶賬號建立互通，使用一套用戶體系可以減少用戶賬號的管理和維護成本。本教程介紹域賬戶類型為LDAP的E-HPC集群如何與Windows AD域建立互通。

接入自定義調度器

E-HPC提供了調度器插件作為平臺的外擴組件，在E-HPC現有調度器類型或版本不滿足當前業務時，您可以通過該插件構建自定義調度器并接入E-HPC平臺的能力。